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《Nature Communications》报道天下首个基于纳米资料构造数字化的纳米生物效应数据库

来路:     著作人:    编辑:chen    公布日期:2020-05-28 14:26    点击数: Views

克日,太陽城官网8888大湾区情况研讨院闫兵传授团队与美国罗格斯大学Zhu Hao传授团队亲密协作,在纳米资料信息化和智能预测方面获得紧张打破,构建了天下首个基于纳米资料构造数字化的纳米生物效应数据库。论文在线发布于Nature Communicationshttp://www.nature.com/articles/s41467-020-16413-3)。

 

       比年来,以数据驱动的人工智能办法,在资料迷信研讨中失掉了普遍的使用。经过呆板学、深度学习等人工智能办法对资料大数据停止训练,可以构建资料构造与其性子之间的定量构效干系模子,应用这些模子,很多还没有实行和实际数据的资料性子可以被预测出来,这将大大减速新资料发明及相干研讨。在这一进程中,包括资料原子构造的数据库(相似小分子数据库PubChem和生物大分子数据库Protein Data Bank)是一个须要条件和中心要素。而在纳米生物效应阅历了30年的研讨后,并没有一个如许的数据库,致使于科研任务者们固然坐拥巨大的纳米生物效应大数据,却不克不及无效的从中提取要害信息。

 

这项研讨经过盘算办法,从原子层面临实行测得的纳米资料构造停止剖析,将其转换并存储为盘算机可以间接读取的电子文件。应用这些电子文件,可以失掉纳米构造的细致三维构造图像,这为我们提供了有关纳米资料外表化学和理化性子的直观剖析。进一步应用所构建的新型纳米描绘符,以及呆板学习和深度学习办法,我们就可以对多种纳米资料的差别理化性子与生物效应的联系关系停止建模和精确预测。这个数据库经过网站(http://www.pubvinas.com/)向全天下研讨职员开放,这些停顿将大大减速纳米资料构造和生物效应大数据到要害信息的转换。

澳大利亚闻名化学信息学家David A. Winkler评价“这个研讨课题非常紧张。十多年来,触及纳米平安评价、纳米资料设计等科研项目所寻求的一个紧张目的,便是构建一个包括有关纳米资料构成、构造、理化性子和生物效应等信息的数据库。”

该项任务失掉了国度重点研发方案、国度天然迷信基金以及广东省“珠江方案”引进创新创业团队等赞助。


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